故事講述了美國中央情報局一個名叫“紹特”的女特工（安吉麗娜•朱莉 飾），她被當局誣陷投靠俄羅斯並要刺殺美國總統，為了洗清罪名，紹特獨自踏上了亡命之旅。《特工紹特》最大的賣點恐怕就是電影中途換角，湯姆•克魯斯因為角色與《碟中諜》系列過於相像而放棄，安吉麗娜•朱莉代替其出演，這樣“男變女”的乾坤大挪移充分顯示了好萊塢明星制的威力，但會不會給影片品質帶來什麼影響？還得看過才現分曉。從預告片中來看，本片不論是驚悚氛圍的營造還是動作場面的設計，都十分老派，沒有花哨的特效場面，追逐打鬥都是硬碰硬的風格。
　　故事開始於北韓，一個美國女商人伊芙琳•紹特（安吉麗娜•朱莉飾演）被朝鮮人民軍以間諜罪拘捕。健壯的士兵一次又一次虐待者這個美國女人，逼她承認自己是美國的特工。幸運的是，經過一個仰慕她的徳裔生物學家（好像是吧，我一般不太關注男角色的背景）在各界奔走呼籲，美國終於同意用人質換回紹特。紹特脫離苦海後，被那個四處奔走解救自己的男人所打動，於是二人終於走到了一起。
　　又過了一段時間，紹特每天享受著丈夫無微不至的關懷，兩人幸福的生活在一起。直到有一天，CIA抓住了一名俄國特工，紹特身為一名CIA幹員，和她的上司一起對其進行審問。然而審問的結果令大家瞠目結舌，俄國佬特工承認前蘇聯時代他領導著一個秘密的特務組織，成員都是未成年的孩子，他把這些孩子洗腦後再派遣到美國，以便在未來發揮他們的作用。而老特工更透露近期將有其中一名經他訓練的特務發起針對來美國訪問的俄國總統的刺殺，而這名特務的名字則是——SALT，紹特，伊芙琳•紹特。匆匆送走了俄國老特務，紹特面對著同事們懷疑的眼神，歇斯底里的詢問自己的丈夫是否平安，因為她認為對方一定是綁架了他以此脅迫自己。果然，她嘗試往家裏打電話而平時此刻丈夫應該在家卻無人接聽電話。
　　很快的新的壞消息傳來，俄國老特務趁CIA看守人員不備將其殺死並成功的逃離CIA總部。而趕去指揮的紹特的上司卻發現身份可疑的紹特也正在逃離總部大樓。紹特的同事們都認為這是她心虛的表現於是更加認為她確實是俄國特工。經過一番激烈的追逐，紹特脫離了警方和CIA的追捕。
　　美國副總統於任期逝世，世界各地的政要前來弔喪，俄國總統也在其中。儀式將在大教堂舉辦，而染成黑髮的紹特也混入教堂。她製造了一起爆炸使俄國總統單獨落入她的陷阱，最終在一名一直認為她就是俄國特工的黑人CIA同事的面前射殺了俄國總統。看著俄國總統逐漸停止了掙紮，紹特扔下了手槍向黑人探員投降。
　　然而在押送紹特的途中，她再一次成功的製造了警車事故並再次逃出升天。逃離的紹特來到海邊一艘破舊的船上，原來那個成功逃脫的蘇聯老特務也在此等她。原來紹特真的是俄國的一名特工。她在船上不只見到了老特工和那些當年曾經和她一起接受訓練的特工少年們，也見到了自己被綁架的丈夫。原來果然是老特務懷疑紹特的忠誠，於是抓住他的丈夫以此要脅紹特為他們做事。但是紹特還是估計錯了曾經的教官，老特務殘忍地在紹特面前槍殺了她的丈夫。