在上一集的故事結束後3年,巴西裏約特別員警行動部隊隊長納西門托的個人和家庭生活成為了《精英部隊 2》的主線。
　　裏約特別員警行動在一次平復監獄暴動的行動中吃了大虧,傷了元氣。隊長納西門托雖然平步青雲,但也因為這次事件的影響受到了牽連。這時候,一場大規模的政治鬥爭在巴西的土地上燃燒開來,上至總統貴族,下至販夫走卒,統統都受到了影響。不僅僅是警察局、連軍隊和特別員警部門都惹了麻煩。不過,對於納西門托來說,他不僅有外患,而且還有內憂。他的正值青春期的孩子漸漸脫離了納西門托的監管,跑到了里約熱內盧的街頭,做了一個小混混。他的這種行為,直接對他的繼父產生了巨大的影響。
　　在這個年齡,在這樣的一個國家,納西門托要如何才能安身立命,要如何才能安穩地活下去?