熙攘鬧市街頭突然發生爆炸，現場一片混亂，三名死者中的主婦千尋（石田百合子 飾）則是警視廳公安部特務第一課警部倉木尚武（西島秀俊 飾）的妻子。由於涉嫌恐怖組織襲擊，警視廳方面安排公安和搜查一課共同組建搜查本部，然而倉木卻被排除在外。案發後搜查一課警部補大杉良太（香川照之 飾）與倉木有過一面之緣，他輾轉找到曾在現場露面的公安部公安二課巡查部長明星美希（真木陽子 飾）試圖弄清事件背後的真相。與此同時，倉木也獨自展開調查，並從美希那裏得到重要情報。遠離喧囂的另一頭，被稱作殺手的新谷和彥（池松壯亮 飾）被人推下懸崖，僥幸逃生的他記憶喪失，而他似乎正是爆炸事件的關鍵人物。撲朔迷離的案情，被刻意隱瞞的真相與事實，爭分奪秒的戰爭已全面展開……