故事發生在一個所有哺乳類動物和諧共存的美好世界中，兔子朱迪（金妮弗·古德溫 Ginnifer Goodwin 配音）從小就夢想著能夠成為一名懲惡揚善的刑警，憑借著智慧和努力，朱迪成功的從警校中畢業進入了瘋狂動物城警察局，殊不知這裏是大型肉食類動物的領地，作為第一只，也是唯一的小型食草類動物，朱迪會遇到怎樣的故事呢？
近日裏，城中接連發生動物失蹤案件，就在全部警員都致力於調查案件真相之時，朱迪卻被局長（伊德瑞斯·艾爾巴 Idris Elba 配音）發配成為了一名無足輕重的交警。某日，正在執勤的兔子遇見了名為尼克（傑森·貝特曼 Jason Bateman 配音）的狐貍，兩人不打不相識，之後又誤打誤撞的接受了尋找失蹤的水獺先生的任務，如果不能在兩天之內找到水獺先生，朱迪就必須自願離開警局。朱迪找到了尼克，兩人聯手揭露了一個隱藏在瘋狂動物城之中的驚天秘密。